El interior es de una sola nave con artesonado mudéjar y bóveda de crucería gótica separados por un gran arco toral apuntado. Los paramentos se encuentran revestidos con zócalos de azulejos de cuerda seca de bella policromía y reflejos dorados. El suelo está revestido por losetas de mármol modernas.
Presenta
tres fachadas, la principal se contrató por Martín Sánchez en 1.514, y muestra
una portada en ladrillo bícromo compuesta por un sencillo arco conopial
enmarcado con un alfiz, la del lado derecho presenta una ventana gótica con
arquivoltas y dos ventanas cuadradas entre pilastras surgidas de la reforma del
siglo XVII, por último la fachada de la cabecera fue reformado hace unos años.
La espadaña
de la capilla se levanta sobre el presbiterio y al igual que la portada
principal, es de ladrillo bícromo rematándose por almenas escalonadas.
Es el
único vestigio de la Antigua Universidad fundada por Maese Rodrigo en 1506.
Responde
al estilo gótico-mudéjar de la época.